Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIBP1Q86W92 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms