Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms