Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT28Q7Z3Y7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT28Q7Z3Y7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms