Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEND4Q6ZU67 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEND4Q6ZU67 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms