Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNE3Q6ZMZ3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms