Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSSK4Q6SA08 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms