Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF7Q6Q0C0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF7Q6Q0C0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms