Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL35Q6PF15 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms