Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRNP1Q6NT89 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms