Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRIP1Q5VSL9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms