Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms