Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PERM1Q5SV97 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms