Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL12Q53G59 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms