Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC38Q502W7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms