Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NBPF1Q3BBV0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms