Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TWISTNBQ3B726 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TWISTNBQ3B726 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms