Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ISXQ2M1V0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms