Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RTL8BQ17RB0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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