Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms