Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRADDQ15628 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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