Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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SF3A1Q15459 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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SF3A1Q15459 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20■□□□□ 0.79
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SF3A1Q15459 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SF3A1Q15459 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SF3A1Q15459 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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