Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms