Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB3GAP1Q15042 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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