Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms