Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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NCAPHQ15003 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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NCAPHQ15003 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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NCAPHQ15003 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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NCAPHQ15003 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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