Protein–RNA interactions for Protein: Q14D33

RTP5, Receptor-transporting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP5Q14D33 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTP5Q14D33 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RTP5Q14D33 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RTP5Q14D33 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP5Q14D33 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms