Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms