Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSHL1Q14406 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms