Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF2H2Q13888 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF2H2Q13888 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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