Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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ITGA9Q13797 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA9Q13797 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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