Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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