Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF5Q13568 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF5Q13568 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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