Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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