Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAD4Q13485 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms