Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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