Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE3BQ13370 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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