Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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