Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PRKAA1Q13131 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PRKAA1Q13131 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PRKAA1Q13131 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKAA1Q13131 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms