Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GRIK3Q13003 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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