Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GRIK2Q13002 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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