Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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STX4Q12846 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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STX4Q12846 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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STX4Q12846 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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STX4Q12846 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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STX4Q12846 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STX4Q12846 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STX4Q12846 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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