Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNMA1Q12791 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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KCNMA1Q12791 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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KCNMA1Q12791 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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KCNMA1Q12791 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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KCNMA1Q12791 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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KCNMA1Q12791 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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KCNMA1Q12791 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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KCNMA1Q12791 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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KCNMA1Q12791 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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