Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms