Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAM27E3Q08E93 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAM27E3Q08E93 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms