Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLFN5Q08AF3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms