Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms