Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSME1Q06323 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms