Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AL354892.3-201ENST00000586101 1630 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC090680.1-201ENST00000464696 860 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms