Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKCDQ05655 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRKCDQ05655 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms