Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms